chromatin interaction analysis by paired-end tag sequencing(ChIAPET) 配对末端标签测序分析染色质相互作用技术

配对末端标签测序分析染色质相互作用技术是一项在全基因组范围内分析远程染色质相互作用的新技术。它把染色质免疫沉淀技术、染色质邻近式连接技术、配对末端标签技术和新一代测序技术融为一体,在基因组三维折叠和套环状态下分析基因表达及调控。ChIA-PET技术应用了PET测序技术的基本原理。PET测序技术的独特之处在于构建配对末端测序模板。从目的DNA片段两个末端提取短标签并将它们配对构成一个PET,对PET进行高通量测序,利用标签序列定位目的DNA片段在基因组中的位置。该技术可实时捕获全基因组范围内参与复制、转录过程的蛋白质因子结合位点以及结合位点间的相互作用,这对于阐明基因调控和疾病发生机制具有重大意义。